Perpustakaan Balai Diklat Keagamaan Aceh telah melakukan Perjanjian Kerjasama Antar Perpustakaan dengan beberapa Perguruan Tinggi Islam, sebagai berikut:
1. UIN SYARIF HIDAYATULLAH JAKARTA
2. UIN SULTAN SYARIF KASIM RIAU
3. UIN SUNAN GUNUNG DJATI BANDUNG
4. UIN MAHMUD YUDUS BATUSANGKAR
5. IAIN FATTAHUL MULUK PAPUA